Suomen Merimieskirkko ry:n korkeimmat päättävät elimet ovat vuosikokous ja vaalikokous.
Vaalikokous
Merimieskirkon kesäjuhlan yhteydessä pidettävä vaalikokous (ks. §17) mm. valitsee yhdistyksen hallituksen.
Yhdistyksen vaalikouksessa käsitellään sääntöjen 17 §:ssä määritetyt asiat:
1. kokouksen avaus;
2. valitaan kokouksen puheenjohtaja, sihteeri, kaksi pöytäkirjantarkastajaa ja tarvittaessa kaksi ääntenlaskijaa;
3. todetaan kokouksen laillisuus ja päätösvaltaisuus;
4. hyväksytään kokouksen työjärjestys;
5. kuullaan hallituksen katsaus yhdistyksen toiminnasta ja taloudesta;
6. valitaan hallituksen jäsenet erovuoroisten tilalle;
7. valitaan yksi tai kaksi tilintarkastajaa ja heille varatilintarkastajat;
8. käsitellään muut kokouskutsussa mainitut asiat:
9. kokouksen päätös.
Vuosikokous
Keväällä pidettävässä vuosikokouksessa (ks. §15) päätetään mm. tilinpäätöksen vahvistamisesta ja vastuuvapauden myöntämisestä, vahvistetaan toimintasuunnitelma ja talousarvio sekä vahvistetaan jäsenmaksujen suuruus.
Yhdistyksen vuosikokouksessa käsitellään sääntöjen 15 §:ssä määritetyt asiat:
1. kokouksen avaus;
2. valitaan kokouksen puheenjohtaja, sihteeri, kaksi pöytäkirjantarkastajaa ja tarvittaessa kaksi ääntenlaskijaa;
3. todetaan kokouksen laillisuus ja päätösvaltaisuus;
4. hyväksytään kokouksen työjärjestys; esitetään tilinpäätös, hallituksen toimintakertomus ja tilintarkastajien lausunto;
5. päätetään tilinpäätöksen vahvistamisesta ja vastuuvapauden myöntämisestä hallitukselle ja muille vastuuvelvollisille;
6. vahvistetaan toimintasuunnitelma ja talousarvio;
7. vahvistetaan jäsenmaksujen suuruus;
8. määrätään hallituksen jäsenten ja tilintarkastajien palkkiot;
9. päätetään vaalivaliokunnan koosta;
10. valitaan vaalivaliokunta;
11. käsitellään muut kokouskutsussa mainitut asiat.
Suomen Merimieskirkko ry:n rekisteröidyt säännöt.